绿头野鸭的抗病能力比家鸭强，一般成年鸭较少患病，但育雏期对温度、饲料品质和营养水平的要求较严，很少因传染性疾病而死亡。因饲养管理不当使雏鸭患病死亡，则是雏鸭死亡的主要原因。冬季和早春气温低，育雏管理如不注意保温，则鸭雏易打堆受害和受寒拉稀、感染肺炎，并造成死亡。霉变饲料易引起绿头野鸭霉菌中毒，其死亡率高于北京鸭与绍鸭。因此，野鸭饲料必须新鲜。
虽然绿头野鸭抗病力强于家鸭，疾病较少，但在人工驯养及常与其他禽类接触的条件下也可感染不少禽类疾病。常可发生的疾病有鸭瘟、鸭病毒性肝炎、禽流感、禽霍乱、鸭疫巴氏杆菌病、大肠杆菌病、沙门氏菌病、禽丹毒、衣原体、绦虫病与棘头虫病等。鸭场应做好防疫综合措施。现介绍部分常见疫病如下。
(一)鸭瘟
1．病原
鸭瘟又称病毒性肠炎，是鸭瘟病毒引起游禽类候鸟的急性败血性传染病，绿头野鸭亦易感染发病。本病可全年发生，但夏秋季多发。幼鸭、成鸭均可感染，但种鸭发病死亡率高。病原存在于病鸭及带毒鸭分泌排泄物中，可通过消化道、呼吸道、交配、伤口与吸血昆虫等多种途径传播。
2．症状
潜伏期2;5天。病鸭精神沉郁，厌食或绝食，腿麻痹无力，严重腹泻，拉绿色稀粪。鼻流黏液，呼吸困难，眼流浆液性或黏液浓性液体，结膜出血有小溃疡。部分病鸭头颈肿胀。病程2;10天。
3．病变
头颈皮下水肿，皮肤出血，体内黏膜浆膜及多处器官出血。肝、脾脏肿大出血及灰黄小坏死灶。特征病变为口腔、食道及泄殖腔黏膜坏死，形成灰白色或黄褐色痂。肠黏膜出血及小坏死灶，小肠环状带出血、肿胀及表面坏死。
4．防治
在疫区，每年用鸭瘟弱毒苗对鸭群定期接种，可预防本病。20日龄雏鸭或成年鸭用苗后免疫期可达半年。发病后鸭瘟弱毒苗全群紧急接种也可控制疫情。病鸭用鸭瘟血清0．5毫升／只肌注，有一定疗效。同时作好鸭场消毒及病死鸭处理。
(二)病毒性肝炎
1．病原
是鸭肝炎病毒引起雏鸭发生的一种传播迅速和高度致死性的传染病。本病主要发生于5;10日龄雏鸭。在孵化季节，可在雏鸭中很快传播，常经消化道、呼吸道感染。
2．症状
潜伏期1;4天，突然发病，病程短促。病初精神委顿，不能随群走动，不食，眼半闭呈昏睡状态，有的腹泻。随后病鸭出现神经症状，不安，运动失调，身体倒向一侧，两脚发生痉挛，数小时后死亡。死前头向后弯，呈角弓反张姿态。
3．病变
肝脏肿大柔软，外观呈淡红色或花斑状，表面有出血点或出血斑。胆囊肿大，充满胆汁。脾脏有时肿大外观有花斑，多数鸭肾脏充血、肿胀。其他脏器无明显变化。
4．防治
本病尚无治疗药物。发病后可用高免血清或康复后鸭的血清进行早期治疗(0．5毫升／只，肌肉注射)，可减少死亡和阻止疫病的扩散。另外在收集种蛋前2;4周，给产蛋雌鸭肌肉注射弱毒鸭肝炎疫苗，可通过卵黄将母源抗体传递给雏鸭，使其在15天内具有一定的抗病能力。对无母源抗体的雏鸭也可直接注射弱毒鸭肝炎疫苗。
(三)鸭疫巴氏杆菌病
1．病原
本病又称鸭传染性浆膜炎，由鸭疫巴氏杆菌引起，主要感染家鸭，野鸭亦有易感性。1;8周龄雏鸭易感染发病，恶劣环境及大肠杆菌等并发病可促进发病，死亡率20％;75％不等。
2．症状
急性病鸭眼鼻分泌物增多，咳嗽与喷嚏，腹泻及运动失调，病程2;3天。慢性者拉稀、消瘦，步态不稳。部分病鸭有神经症状。
3．病变
特征性病变为心包、肝周及气囊附着灰白色纤维素。脾脏肿大、充血斑驳。有时见鼻窦内黏液浓性渗出物。
4．防治
氯霉素0．4;0．6克/千克或0．6;0．8克/千克土霉素拌料投药3;5天，配合使用B族维生素有较好的效果。根据用药效果，交替使用庆大霉素、新生霉素及林肯霉素亦能显著降低死亡率。
平时应加强鸭舍通风、干燥、防寒及清洁卫生工作。鸭疫巴氏杆菌灭活苗或与大肠杆菌混合灭活苗接种7;10日龄雏鸭，可预防本病。
(四)鸭霍乱
1．病原
鸭霍乱也叫鸭出血性败血病、鸭巴氏杆菌病。是由禽型巴氏杆菌引起的对鸭危害极大的传染病。成年野鸭较易感染发病，死亡率很高。
2．症状
急性型鸭群突然死亡；亚急性型病鸭精神不振，体温升高，不食，爱喝水，不喜欢活动，呼吸加快，下痢，呈绿色或白色稀粪，发病快，死亡率高；慢性型病鸭关节水肿性肿胀，跛行，常见咳嗽。病鸭病愈后，为带菌者。
3．病变
最急性病例尸体剖检常未见特殊病变。急性病例，可在皮下组织，心冠脂肪，肺、气管、腹腔浆膜发现大小不等的出血点；肠黏膜有程度不同的充、出血，尤其十二指肠最为严重；肝脏肿大，呈土黄色，表面密布针尖或针头大灰黄色坏死点，这是本病特征性病变。
4．防治
加强饲养管理，搞好清洁卫生，发现有病发生，必需封锁、隔离和消毒。发病鸭群，注射出血性败血症血清。未发病鸭接种禽霍乱疫苗，1月龄以上鸭，肌注2毫升。在饲料中加入磺胺噻唑，0．5％;1．0％饲喂，连续喂几天，同时加喂B族复合维生素，可减少影响生长发育、产蛋下降等副作用。每只成鸭肌注链霉素10万国际单位或青霉素2万国际单位，每天2次，可治疗本病。
(五)曲霉菌病
1．病原
由烟曲霉菌引起的一种真菌病。发霉饲料、垫草以及霉菌污染的食槽、用具是主要的传染源。野鸭吃了霉变的饲料，易引起霉菌中毒，死亡率较高，尤其是幼鸭。
2．症状
多发生于2周龄内的雏鸭，病鸭精神萎靡，闭眼瞌睡，食欲减退或不食，口渴，吞咽困难。病情严重时，呼吸困难，张口呼吸，口、鼻有分泌物，后期下痢，消瘦虚弱而死亡。
3．病变
气管和支气管中有淡黄色渗出物，肺部有小米粒大到绿豆大的黄白色或灰白色结节，较为坚实，内容物呈干酪状含大量菌丝体。
4．防治
不喂发霉饲料，食槽、水槽、用具每天洗刷，保持清洁。鸭舍应通风、清洁、干燥，垫草保持干燥，鸭舍定期进行消毒。治疗可在饲料中加入制霉菌素，雏鸭每只每天用量为2;3毫克。
(六)衣原体病
1．病原
为鹦鹉热衣原体引起的多种禽类接触性传染病。野鸭也可感染。病原经病鸭呼吸道及消化道排出，健康鸭吸入空气中粪尘或飞沫而感染，也可经蛋传播。饲养管理不良，沙门氏菌及鸭疫巴氏杆菌也可并发感染本病。
2．症状
幼鸭精神不振，食欲废绝，眼鼻发炎，呆立颤抖，步态不稳，腹泻衰竭，后期痉挛死亡。死亡率0;30%，取决于年龄及并发病。
3．病变
病变类似鸭疫巴氏杆菌病及大肠杆菌病。气囊、心包、肝、脾脏表面触片，姬姆萨染色镜检，单核细胞浆内见包涵体可以确诊。
4．防治
氯霉素、金霉素混料投服，可同时控制鸭疫巴氏杆菌病及大肠杆菌病。
平时禽舍应防止其他禽类及野鸟进入，加强场地清洁卫生及消毒。
(七)鸭棘头虫病
1．病原
是多形棘头虫寄生于鸭科禽类肠道而引起的寄生虫病。绿头野鸭易感性强，幼鸭危害严重，死亡率高于成鸭。棘头虫常以几种淡水虾类为中间宿主，鸭吞食含有感染性幼虫的虾类而发病。感染季节多为7;8月份。
2．症状
幼鸭严重时表现为贫血、衰竭与死亡。成鸭多无明显症状。
3．病变
小肠内寄生的虫体呈橘红色、纺锤形，长几毫米至14毫米，以其吻突牢固地叮附于黏膜上。肠固有黏膜出血与溃疡，浆膜增生小结节。
4．防治
可用硝硫氰醚每千克体重100;125毫克/1次投服，或用四氯化碳每千克体重0．5;2毫克1次嗉囊投入。
平时应每年干塘，消灭中间宿主，定期驱虫及加强鸭粪处理。
