对于养猪业来说，最让人头疼的事情莫过于传染病的流行迅速。举个例子，有可能一场流行病刚刚还在亚洲流行，但不久就会在欧洲爆发，或者在其它洲出现。然而养猪人及多数经济学家认为在全世界范围内，养猪业是朝阳产业，会越做越大的。养猪业的效益取决于养猪的经济规模，然而养猪业的规模越大，猪发生传染病的风险也越大，因此必须找出一个最佳规模，从而使养猪的经济效益最佳，但发生传染病的机率降低。养猪的经济效益再好，养一头猪所产生的效益总是很低的，整个猪群的经济效益取决于规模大小。传染病是怎样传播的？其主要的传染源是：空气、水、人类、寄生虫、鸟类、粪肥，车辆、饲料，当然，还包括猪群本身。在30年前的英国，一个100头母猪的猪场可以算作较大的猪场了。这样的猪场在进场时也并不认为需要换靴子，就算是对一个典型猪场来说也是这样的。当时的词典中没有生物安全这一概念。大多数养猪场也没有要求对运送饲料的车辆进行消毒，也没有规定的运送路线，运输车辆还可以在各猪场之间往返运输，如果猪场人员和拉猪的司机很熟的话，司机还会帮助猪场装猪。对猪生物安全的不重视，导致传染病病猖獗。在二十世纪七十年代早期，英国约克郡东部的猪水疱病十分猖獗。很多运输车辆来回运猪，并且使用同一个很大的进料器。根本没有注意到货车或者司机可能成为传染病传播的途径。正确的计划是建造合理的围墙，做好隔离措施，建立特定的运输通道，这是非常有必要的。对猪场建筑进行合理布局，用篱笆和墙将各个区隔开，这样运送饲料的车辆就没有必要直接进入猪舍区域。在美国和加拿大见到养猪业的多点式生产，这样做的好处是疾病扩散被限定在特定日龄段以及特定重量的猪，这样疾病扩散的范围就比较窄。大多数猪场通过空气传播疾病。因此，英国养猪人通过降低猪舍密度来降低通过空气感染疾病的机率。在英国一座比较先进的养猪场被四座养猪场所包围。育种公司往往愿意将分公司建在养猪场集中的地方，但每座猪场的周边半径必须有3英里（即4.8km）的间距。约翰霍普金斯学校公众健康研究中心的研究人员报道，在猪舍里使用一种特殊油状制剂可以抑制细菌数量，使细菌数量减少10％。通过水源也可以传播疾病。在不同批次的猪之间，养猪人对墙壁和天花板进行冲洗和消毒，但却忽略对水槽、管子及饮水器的消毒。因此应该给水槽加盖，防止因虫子落入而污染水源――发现虫子落入未加盖的水槽中是很常见的事情――这不是很理想的情况。撒出的饲料往往被扫到一起，特别是在冷天，虫子容易在撒出的饲料中生存，因为饲料是比较温暖的生存环境。鸟类传播疾病是非常热门的问题，人们对其关注程度和对禽流感的关注程度相当。温带或热带大多数国家的猪舍是开放式结构，鸟类可以飞入，带菌的鸟粪落入圈舍中是感染的潜在原因。本文中给出的办法是用电网或者网状结构进行预防。人类活动也是猪传染病的一大原因。通常每栋猪舍由一个饲养员管理，若一个饲养员管理多个猪舍，在进入另一栋猪舍前必须换鞋子。多少天没进入猪舍的话，进入猪舍前最好先进行淋浴。要进入丹麦的猪场，在进场前必须在该国呆上48小时以上才允许进入该国的猪场。这看来有些强迫的性质，但您听听夏威夷猪场的情况，您就可以理解了。若要进入夏威夷的猪场，就必须做好周详的计划，必须远离猪舍14天以上。粪肥中包含传染性物质。由于认真打扫、严格消毒非常重要，因此在养猪的不同批次之间有必要对墙角、地板、天花板、坑窖及设备进行严格的消毒处理。理想情况是对坑窖采取严格的清洁消毒处理，但是对旧猪舍来说，很难做到这一点。稻草上常粘有固体粪肥。如果必须买稻草做垫草，必须确保稻草上不粘有猪粪。运送稻草的车辆进入猪场必须经过场门口的消毒池，当然，消毒剂必须非常有效，而且对司机和同伴也必须进行消毒。四轮马车或货车可用来运送需要更换的小母猪。很多养猪人试着减少更换母猪的数量。每一次更换母猪都可能会导致感染，如果母猪必须更换，那么在整群前必须对新加入的猪群先进行隔离再混群。由于每年要更换35%－40%的母猪，因此更换母猪成了最大的风险。另一方面，是说通过人工授精也可能传染疾病。有一些大的养猪场甚至有他们自己的人工授精群，有他们自己的公猪核心群，这些猪场可以自己采集精液，这样可以控制整个养猪过程。在这种情况下，每年需要更换的公猪数比较少。传染病和传染病的控制是非常复杂的事情。所有过程和记录协议都需要花时间和金钱来贯彻执行和保持，但必须有效使用时间和金钱，否则疾病可能使养猪的效益迅速削弱。
